La bibliothèque universitaire conserve 483 incunables. L'histoire de la collection présente les mêmes avatars que celle des manuscrits : dans celle-ci nous trouvons des exemplaires originaires des bibliothèques d'Alonso Ortiz, Núñez de Guzmán, du collège des jésuites et des collèges universitaires. Il existe aussi des acquisitions plus récentes, comme Leyes del estilo (Salamanque 1497, Inc. 387) ou les oeuvres philosophiques de Petrus Tartaretus (Lyon 1498, Inc. 388).

Les incunables de cette collection sont sortis en majorité des presses italiennes, spécialement de Venise : les incunables vénitiens représentent 40 % de l'ensemble. Entre ceux-ci il y a quelques raretés, comme le Cosmographia de Pomponio Mela (Venise, c. 1498, Imp. 37262-2).

Dans les incunables espagnols il y a aussi quelques raretés : les Instructiones curatorum de l'évêque de Huesca Juan de l'Aragon (Saragosse c. 1488-1491, Imp. 26079-4) ; les Differentiae de Nebrija ou Proba falconia, les deux de la première et anonyme presse de Salamanque (c. 1487-1490, Inc. 386-4 y 386-3).

  

Catalogue du fonds incunables

• Riesco Bravo, Fulgencio, Catálogo de los incunables existentes en la Biblioteca Universitaria de Salamanca, Madrid, 1949.
• Santander Rodríguez, Teresa, Incunables de la Biblioteca Universitaria de Salamanca: suplemento, Salamanca: Biblioteca Universitaria, 1990.